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1、旋轉蒸發器容量的選擇：這里的容量一般指的是蒸發瓶的容量，一般高校和實驗室中用的比較多的旋蒸儀器容量在1-50L以內。
2、加熱鍋加熱溫度及加熱介質的選擇：加熱鍋的溫度應高于溶劑揮發性沸點20度。如果使用真空泵，請注意所選真空值下的沸點。自來水或蒸餾水一般用于加熱介質。由于目標成分的熱敏性，操作的穩定性建議使用 50℃ 加熱，避免燙.傷。使用高溫或者油浴時，應考慮配套使用加熱鍋蓋防護。
3、冷卻器的選擇：首先，根據試驗冷凝效率的要求，選擇冷凝面積合適的冷凝器。對于冷凝面積相同的冷凝器，市場上通常有垂直冷凝器和傾斜冷凝器。對于實際應用效果，冷凝效果相當，可根據自身實驗室的空間位置選擇不同的型號。
4、旋轉蒸發瓶樣品加樣量的控制：加樣量在1/3左右，一般不超過1/2。在蒸發瓶旋轉過程中，由于液體樣品與蒸發瓶之間的向心力和摩擦力的作用，液體樣品會在揮發瓶內表面形成薄膜。適當的樣品量可以使薄膜面積達到zui大，提供更好的蒸餾效率。
5、其他事項：不能設置高于溶劑沸點的溫度。一旦超過樣品沸點，就很容易爆裂。此外，在蒸餾過程中應避免真空值的突然降低，這也會導致溶劑沸點的降低然后導致爆沸的現象發生。如果低沸點濃縮在工作溫度很高的情況下，會導致收集瓶中物質的二次蒸發，可以適當的給收集瓶加冰處理，或者及時倒出濃縮物質。對于特別難蒸餾的樣品，包括容易產生泡沫的樣品，旋轉蒸發器可配備特殊的冷凝管。